中药制药工程学科作为药学院中药制药、制药工程专业的主干学科，最早创建于2002年，2017年获批为陕西省中医药管理局重点学科。经过20年的建设和发展，已形成以史亚军教授为学科带头人的一支特色鲜明的教研团队，现有专职教师16人，其中教授4人、副教授8人，硕士生导师8人，博士学位10人，成为中药学一级学科重要组成部分。

学科立足陕西，聚焦中药制药行业领域，围绕中药制药工程中存在的共性关键技术应用和制药装备升级等方面，形成了三个较为稳定的研究方向：中药制药过程关键技术应用研究、中药制药新技术适宜性研究、中药新型制药设备研究。围绕上述研究方向，在关键技术研究方面，建立了基于中药粉体物料特性的粉体改性与粒子设计技术体系，为中药固体制剂创新设计奠定了理论和实践支撑，研究成果已应用到羚珠散、参苓白术散等产品的质量提升；围绕中药挥发油产业化存在的共性问题，建立了“温控聚集”、"汽浮-聚结”等挥发油提取技术及其过程调控机制等多项核心技术并应用到工业化大生产；同时，学科还围绕磷脂复合物技术、中药鼻腔给药系统等制剂新技术开展了卓有成效的探索。

围绕学科研究方向，近五年承担科研项目20余项，其中国家级科研项目8项；获陕西省科学技术二等奖2项，陕西省教学成果特等奖1项、二等奖1项；其他各级各类奖项10余项；发表学术论文100余篇，其中高水平论文40篇；主编及参编教材及学术专著20余部，授权发明专利10余项，实现成果转化5项。

同时，学科结合团队、平台和技术优势，积极与陕西摩美得制药有限公司、陕西海天制药有限公司等地方制药企业围绕项目申报、产品和技术开发等方面开展多元化合作，为促进陕西中药产业快速发展做出了积极贡献。