中药化学学科于1973年创建，2005年获批校级重点学科，2012年获批国家中医药管理局重点学科建设学科，2018年重点学科验收评审为“优秀”等级。学科现有专职教师21人，其中教授8人，副教授6人，硕士生导师13人，博士18人。 

学科坚持以教书育人为主，教学和科研并举的发展思路。近年来学科培养硕士研究生80余名，其中8名获得国家奖学金；“竹根七根及根茎中甾体皂苷类化学成分的研究”，“铁棒锤中二萜类生物碱及其生物活性研究”等多项研究成果获陕西省研究生创新成果奖。

学科以“资源保护和持续利用---创新药物开发”并举为目标，以“药效物质基础---质量评价”并重为关键科学问题，结合本学科工作积累形成了稳固的三个研究方向：太白七药道地性特征研究、基于抗肿瘤的太白七药药效物质基础及作用机理研究、秦巴优势中草药药效物质基础和作用机理研究。开展了珠子参、开口箭、朱砂七、铁棒锤等20多个“太白七药”品种的化学成分的研究，分析鉴定化学成分结构500多个，为“太白七药”化学成分库的建立奠定了基础；并对制备获得的500个单体化学成分进行了抗肿瘤、抗病毒等活性筛选；开展了南五味子、丹参、山茱萸药效物质基础和作用机理研究。近年来承担科研项目30余项，其中国家自然科学基金9项；发表学术论文200余篇，获得各种奖励和教学科研成果4项，编撰专著和教材40余部，其中“秦巴特色太白七药资源价值发现及其产业化”研究成果于2019年获得陕西省科学技术一等奖的科研奖励，为学科建设发展奠定了良好的基础。

        学科本着“区域性特色中草药为研究对象，以基础研究为主导，带动和发展应用研究”的宗旨，针对中医药领域的关键和热点问题，以原始创新为导向，深化中药基础研究，力争把中药化学学科打造成具有自主培养中药化学行业高层次人才的基地，成为知识创新、技术创新、成果创新的优秀团队。